Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NDUFS5O43920 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms