Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GATCO43716 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GATCO43716 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GATCO43716 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GATCO43716 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms