Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTIFO43310 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTIFO43310 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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