Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LRRTM2O43300 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms