Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
APOC4-APOC2K7ER74 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms