Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms