Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PATL2C9JE40 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PATL2C9JE40 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms