Protein–RNA interactions for Protein: A8MRT5

NPIPB5, Nuclear pore complex-interacting protein family member B5, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB5A8MRT5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NPIPB5A8MRT5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NPIPB5A8MRT5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms