Protein–RNA interactions for Protein: A6NN06

Putative UPF0633 protein MGC21881, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NN06 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
A6NN06 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
A6NN06 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
A6NN06 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms