Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
A4D1N5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
A4D1N5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
A4D1N5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
A4D1N5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4D1N5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4D1N5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4D1N5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4D1N5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
A4D1N5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms