Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf170A2RU37 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf170A2RU37 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms