Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CCDC78A2IDD5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms