Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KBTBD8-202ENST00000460576 984 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC108866.1-204ENST00000508362 558 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZMYM6-202ENST00000357182 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
FOXE3Q13461 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms