Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AMOT-201ENST00000304758 6888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HIST1H2BN-203ENST00000606613 4137 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RPS4X-201ENST00000316084 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CTNND1-205ENST00000399050 6313 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 BRCA1-208ENST00000468300 3273 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HEATR9-207ENST00000604834 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 FRMD6-202ENST00000356218 4768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CD180-201ENST00000256447 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC117382.2-201ENST00000564748 3151 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MSL3-201ENST00000312196 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 DPH3-202ENST00000383775 3052 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TRBV7-5-201ENST00000390382 345 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IGHV2-26-201ENST00000390611 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AF274573.1-201ENST00000430535 494 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC007683.1-201ENST00000432746 591 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TTC39A-212ENST00000447632 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SL841P-201ENST00000470547 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 GAPDHP22-201ENST00000491037 413 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RN7SL598P-201ENST00000494391 294 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MYL6-207ENST00000547649 655 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TMEM106C-212ENST00000549288 321 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ACTN1-AS1-201ENST00000553944 484 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MIR4266-201ENST00000583300 55 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC087393.3-201ENST00000584971 166 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 LINC00663-206ENST00000589910 732 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC005180.1-201ENST00000591137 587 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL121928.1-201ENST00000608017 521 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL139220.2-217ENST00000609027 940 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TRBV10-3-201ENST00000611462 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.71-201ENST00000612122 282 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AC027139.2-201ENST00000615639 448 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 Metazoa_SRP.29-201ENST00000616220 280 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL136140.2-201ENST00000624717 1705 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ANKMY2-205ENST00000627859 210 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HELQ-201ENST00000295488 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 DLEU1-212ENST00000469754 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 KLF5-205ENST00000539231 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MRO-211ENST00000610511 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CEP128-209ENST00000555265 4662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CHODL-203ENST00000400127 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SCN11A-201ENST00000302328 6500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TDP1-203ENST00000393454 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 LY86-AS1-201ENST00000429345 1941 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 NAALAD2-210ENST00000534061 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IQGAP1-214ENST00000560738 3602 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IMPG1-204ENST00000611179 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SLC24A1-203ENST00000399033 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 ZBTB14-207ENST00000614697 3341 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SORBS1-210ENST00000371246 6931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 EPS15L1-214ENST00000602009 3915 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TMPRSS4-219ENST00000616579 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 PPP6R3-206ENST00000524904 4292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 UQCRC2-202ENST00000561553 1415 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SLC2A14-215ENST00000542546 3120 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 CDHR3-211ENST00000478080 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 SNORA14B-201ENST00000384452 135 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
HOXB1P14653 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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