Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GJA3Q9Y6H8 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJA3Q9Y6H8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms