Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
R3HCC1Q9Y3T6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
R3HCC1Q9Y3T6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms