Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BP1Q9Y3L3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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