Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FZD4Q9ULV1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FZD4Q9ULV1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms