Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PNMA2Q9UL42 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PNMA2Q9UL42 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms