Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRAPPC2LQ9UL33 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms