Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFMBT1Q9UHJ3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFMBT1Q9UHJ3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SFMBT1Q9UHJ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFMBT1Q9UHJ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms