Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHRNA9Q9UGM1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHRNA9Q9UGM1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms