Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLIP2Q9UDT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms