Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARHGAP28Q9P2N2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms