Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GSKIPQ9P0R6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GSKIPQ9P0R6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms