Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NKIRAS2Q9NYR9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS2Q9NYR9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS2Q9NYR9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS2Q9NYR9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS2Q9NYR9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NKIRAS2Q9NYR9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms