Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RDH8Q9NYR8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RDH8Q9NYR8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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