Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
DLL3Q9NYJ7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
DLL3Q9NYJ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms