Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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FAM53CQ9NYF3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FAM53CQ9NYF3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FAM53CQ9NYF3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FAM53CQ9NYF3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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FAM53CQ9NYF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FAM53CQ9NYF3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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