Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CWC25Q9NXE8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CWC25Q9NXE8 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms