Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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TMEM30AQ9NV96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM30AQ9NV96 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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