Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM3

SLC39A9, Zinc transporter ZIP9, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A9Q9NUM3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SLC39A9Q9NUM3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms