Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ABCC13Q9NSE7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ABCC13Q9NSE7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms