Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNNBIP1Q9NSA3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms