Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERINC1Q9NRX5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SERINC1Q9NRX5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms