Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ELP3Q9H9T3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ELP3Q9H9T3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms