Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CLMPQ9H6B4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CLMPQ9H6B4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms