Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RAB3GAP2Q9H2M9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAB3GAP2Q9H2M9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms