Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD1Q9GZZ0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXD1Q9GZZ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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