Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLIRPQ9GZT3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLIRPQ9GZT3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms