Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CEP44Q9C0F1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms