Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FOXQ1Q9C009 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FOXQ1Q9C009 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms