Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CDCA4Q9BXL8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms