Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSBP3Q9BWW4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms