Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TMEM208Q9BTX3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TMEM208Q9BTX3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms