Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RHOXF2Q9BQY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RHOXF2Q9BQY4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms