Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BPIFA3Q9BQP9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms