Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARID3AQ99856 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARID3AQ99856 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms