Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EYA3Q99504 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EYA3Q99504 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms