Protein–RNA interactions for Protein: Q99442

SEC62, Translocation protein SEC62, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC62Q99442 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC62Q99442 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms